2008/09赛季欧洲联盟杯小组淘汰赛次回合展开争夺，西甲4支球队全部晋级。五大联赛中，仅有埃弗顿、那不勒斯、多特蒙德和雷恩遭到淘汰。
英超球队
托特纳姆热刺客场1比1战平克拉科夫(波兰)。第58分钟，拜尔左路传中，主队队长格洛瓦奇在从曼联租借而来的弗莱泽-坎贝尔的压力下头球自摆乌龙。克拉科夫第83分钟扳平比分，迪亚兹直传，布洛泽克禁区外劲射破门。热刺总比分3比2晋级。
埃弗顿客场1比2不敌标准列日(比利时)。第23分钟，迪佛22码处劲射被霍华德扑出，约瓦诺维奇传中远点，维特塞尔球门线前轻松破门。埃弗顿一度在第67分钟扳平比分，阿尔特塔开出角球，门将埃斯皮诺萨扑救脱手，加吉尔卡捅射入网。第79分钟，拜恩斯禁区内对约瓦诺维奇犯规，后者亲自主罚点球命中。埃弗顿总比分3比4惨遭淘汰。
曼城主场2比1力克奥莫尼亚(塞浦路斯)。第48分钟，罗比尼奥传球，埃拉诺禁区边缘外低射左下角入网。第55分钟，赖特-菲利普斯禁区右侧射入远角。客队第78分钟扳回一城，阿拉比接角球后头球破门。曼城总比分4比2晋级。。
阿斯顿维拉主场1比1战平利特克斯(保加利亚)。第27分钟，阿什利-扬传球，海伍德闪过尼科洛夫的铲球后劲射破门。第53分钟，库伊拉尔禁区内铲倒汤姆，奈夫洛尔点球一蹴而就。维拉总比分4比2晋级。
意甲球队
AC米兰主场3比1轻取苏黎世(瑞士)。
桑普多利亚客场2比1取胜考纳斯(立陶宛)。第18分钟，莱德斯马开出角球，泽尔米卡斯低射右下角入网。桑普多利亚连入2球逆转，第50分钟，加斯塔德罗接角球后头球摆渡，佛纳罗利远点近距离头球破门。第58分钟，博纳佐利摆脱泽尔米卡斯后小角度射门入网。桑普多利亚总比分7比1晋级。
乌迪内斯主场0比2不敌多特蒙德，点球战4比3取胜。半场补时，布瓦什奇科夫斯基传球，匈牙利中场哈伊瑙尔禁区右侧射入近角。第92分钟，巴尔德斯射门被挡，哈伊瑙尔近距离补射破门将比赛带入加时。双方总比分2比2战平。点球大战，尽管多米兹将皮球射偏。但门将汉达诺维奇先后扑出了哈伊瑙尔和布瓦什奇科夫斯基射出的点球。
那不勒斯客场0比2不敌本菲卡(葡萄牙)。第58分钟，卡楚拉尼斯传球，前阿森纳边锋雷耶斯禁区左侧射入上角。第83分钟，卡洛斯-马丁斯传中，努诺-戈麦斯头球破门。乌迪内斯总比分3比4惨遭淘汰。
西甲球队
瓦伦西亚主场2比1逆转胜马尔蒂莫(葡萄牙)。
桑坦德竞技客场1比0小胜洪卡(芬兰)。。
塞维利亚客场2比0轻取萨尔茨堡(奥地利)。
拉科鲁尼亚主场2比0取胜布兰(挪威)，点球大战3比2晋级。
德甲球队
沃尔夫斯堡客场1比1战平布加勒斯特快速(罗马尼亚)。第16分钟，巴西前锋格拉菲特面对里卡多-费尔南德斯突入禁区右侧劲射破门。主队第70分钟扳平比分，皮特布尔任意球射门被贝纳里奥扑出，马菲特补射入网。沃尔夫斯堡以总比分2比1晋级。
沙尔克04主场1比1战平阿普尔(塞浦路斯)。第6分钟，科索夫斯基传球，平托16码处劲射破门。沙尔克第57分钟扳平比分，潘德尔任意球直接射门入网。沙尔克总比分5比2淘汰对手。
斯图加特主场2比2战平切尔诺(保加利亚)。第47分钟，塔什彻回传莱曼失误，尤尔科夫打入空门。第79分钟，鲁瑟夫左路任意球射入远角。斯图加特连追2球扳平比分，第82分钟，鲁迪开出角球，希策尔斯佩格10码处射门入网。第94分钟，卡考开出角球，戈麦斯头球打入关键球。斯图加特总比分4比3涉险晋级。
汉堡客场2比0取胜乌尔齐切尼(罗马尼亚)。第27分钟，马泰森摆渡，佩特里奇凌空抽射破门。第51分钟，前拜仁前锋格雷罗传球，佩特里奇射入远角梅开二度。汉堡总比分2比0取胜晋级。
法甲球队
圣埃蒂安主场2比1取胜特拉维夫哈波尔(以色列)。
雷恩客场0比1不敌特温特(荷兰)。
南锡客场2比0力克马瑟韦尔(苏格兰)。第18分钟，加瓦隆远射被扑出，福琼近距离补射入网。第23分钟，加瓦隆任意球直接破门。南锡总比分3比0过关。
巴黎圣日耳曼主场0比0战平凯撒里体育(土耳其)。